2011年國儲棉收購了313萬噸，占全國棉花產量的47%。2012年國儲棉收購了634萬噸，占全國棉花產量的90%以上。除去國儲棉已經拋售的部分，加上2011年以前的庫存，當前國儲棉庫存超過了800萬噸，占有國家資金在1600億元左右(每噸按20000元推算)，每年國家要支付的資金利息、倉儲費，以及要承擔的國儲棉高收低拋的損失在300億元左右。國儲棉當前已經實實在在地讓國家背上了沉重的財政包袱。
　　
　　國儲棉給市場帶來的包袱還不僅僅是讓國家財政遭受損失這一項。上述國儲棉庫存龐大的數據已經說明，受高價收儲刺激，國產棉大部分進入了倉庫，這令市場上可供流通的貨源稀少，如果把國內棉花市場當做一個封閉的市場來推演，棉花下游企業只有一個選擇，就是高價采購拋售的國儲棉。假如紡織企業的產品可以實現順價銷售，那么國家進行棉花收儲不會對棉花下游產業造成影響。但現在國內棉花市場并不是完全封閉的市場，國內外棉市的關聯度很高，加上近幾年國際棉價持續走跌，大量進口棉花和進口棉紗涌入國內棉市，造成國內部分中小紡織企業停產，并對我國棉花產業鏈造成了沖擊。
　　
　　業內人士認為，棉花臨時收儲這個原本要穩定國內棉花市場價格、保護和提高農民種棉收益與積極性、防止紡織企業原料采購與生產成本劇烈波動的政策，已陷入了讓棉農收益不多、讓國家背上財政包袱、讓紡織企業難以生存的境地。
　　
　　據相關機構調查，今年我國棉花種植面積為6846萬畝，十年來首次低于7000萬畝的水平。高價收儲沒有保住農民的種棉積極性，原因在于農民并沒有從國家收儲中得到好處。目前，我國棉花種植大部分仍是一家一戶種植的生產模式，機械化程度很低，種植棉花比種植其他農作物費工費時，直接投入也比較大，隨著近幾年農村勞動力的減少和用工成本的大幅提升，農民種植棉花的實際收益是減少的。在我國內地棉花產區山東、河北、湖北，由于種植棉花比較收益差，很多農民已經放棄了棉花種植。
　　
　　金石期貨棉花高級分析師于麗娟告訴期貨日報記者，近兩年國內實施的棉花收儲政策在避免棉花種植面積大幅下滑方面發揮了一定的作用，也支撐棉花價格穩定在相對高位，但政策性調控的局限性也較明顯。例如，政策性收儲的實惠沒有完全落實到棉農身上，棉農種棉積極性仍舊不高。與此同時，國家以明顯高于市場的價格大規模收儲，再按較高的價格拋儲，致使國內棉價維持在高位，導致國內外棉市價差巨大，這削弱了國內棉紡企業的國際競爭力。此外，大規模收儲使國家財政付出了高吸低拋的巨大政策性成本，儲備庫容面臨巨大壓力，雖然短期內挽救了相對脆弱的棉花生產，但也削弱了市場機制自發調節的作用。
　　
　　海關公布的統計數據顯示，2012年我國進口棉紗152.79萬噸，同比增長了68.93%。今年上半年我國進口棉紗96.47萬噸，同比增長了45.88%。同期，我國棉花進口數量也很龐大。一方面國產棉大量積壓，另一方面進口棉紗、進口棉花數量龐大。國儲棉高價收購托高了國內棉價，并使得國內外棉市價差長期保持在4000—6000元/噸，這最終導致沿海地區服裝企業青睞于進口棉紗，紡織企業大量使用進口棉花，而沒有得到進口配額的中小型紡織企業等只能關門停產或倒閉。
　　
　　“國內外棉市的價差(國內CCIndex328和FCIndexM進口棉折算之間的價差)自2012年以來就居高不下，價差按照滑準稅折算時最高曾達5000元/噸，若按照1%關稅折算最高達5600元/噸，當前價差仍在3200—4000元/噸的高位區間徘徊。”于麗娟說，我國棉花價格的高企，使得國內紡織企業面臨巨大的原料成本壓力，紡織業負重前行的日子仍將繼續。
　　
　　從鄭棉期貨市場的表現來看，在國家收拋儲棉花政策的調控下，鄭棉期市成交清淡，日成交量僅維持2萬手左右，盤面持倉量在12萬手左右，遠低于交易活躍時期300萬—400萬手的日成交量和50萬—60萬手的持倉量。對比歷史數據可以發現，當前鄭棉期市的量倉水平幾乎接近于2008年前的規模，鄭棉期市的交易活躍程度很低。
　　
　　此外，在鄭棉倉單方面，由于國家無限量地收儲，大部分高等級棉花進入了國儲庫，市場上可供注冊倉單的棉花數量極少。今年年初，鄭棉注冊倉單最大量為488張，此后倉單量持續萎縮，當前僅為214張。而在以往絕大部分年份，鄭棉倉單注冊最大量均高于今年。鄭棉倉單注冊量嚴重不足，導致鄭棉期市一直存在價格隨時會大幅波動的風險，鄭棉臨近交割月的合約保證金也被迫提升，又加劇了鄭棉期市交易清淡的局面。